残高が合わない/マイナスになっている（「普通預金」の場合）

実際の預金通帳に記載されている普通預金の残高と、帳簿の普通預金の残高は一致させる必要があります。
「普通預金」の残高が合わない、またはマイナスになっている場合、以下が発生している可能性があります。

期首残高を入力していないか、誤りがある
入力した取引内容に誤りがある
入力漏れの取引がある

原因の特定と対処方法を以下のステップで確認していきます。

ステップ1 いつから合わないのか、マイナスなのかを確認する
　ステップ1-1 ［期首残高］を確認する
　ステップ1-2 ［期中の残高］を確認する
ステップ2 取引帳と取引先ごとの請求書等、または通帳やネットバンキングの入出金明細等で確認する
ステップ3 入力間違いの修正や入力漏れの追加を行う
ステップ4 正しい残高に更新されたことを確認する

ステップ1-1 いつから合わないのか、マイナスなのかを確認する：［期首残高］を確認する

本年度の［期首残高］を確認します。

メインメニューの［レポート・帳簿］から［残高試算表］をクリックします。［残高試算表］画面が表示されます。
期間設定を「年指定」に変更し、期首残高を確認したい年度を選択して「貸借対照表」を表示します。「普通預金」の前期繰越欄に表示されている銀行ごとの期首残高が正しいかを取引先ごとの請求書等、または通帳やネットバンキングの入出金明細等で確認します。
銀行名を登録していない場合は、「普通預金」の期首残高を確認します。

「普通預金」の金額が正しい場合は、ステップ1-2 ［期中の残高］を確認するに進みます。

「普通預金」の残高が合っていない、マイナスになっている場合

期首残高を修正することで、前年度分の決算書の金額（期末残高）と異なってしまいます。
期首残高を修正する前に、本年度の期首残高を修正する旨を税務署へお伝えいただくことをお勧めします。
「普通預金」の金額が間違っている場合は、正しい金額に修正して［登録］をクリックします。画面左下の［設定メニュー］から［残高の設定］を開き、［期首残高を設定する］のチェックが入っていることを確認し［▼］をクリックして「本年度」を選択します。
［普通預金］科目の銀行別の期首残高を直接正しい金額に修正し、［登録］をクリックします。
ここでは「南銀行」の期首残高を修正する場合で説明しています。
銀行名を登録していない場合は、直接［普通預金］の期首残高を修正します。

「残高がマイナスになっている科目があります。このまま登録してよろしいですか？」のメッセージが表示される場合

［いいえ］をクリックして、残高がマイナスになっている科目をクリックして修正し［登録］をクリックします。
「登録が完了しました。」の［OK］をクリックします。
［普通預金］の残高が、正しい残高に更新されたことを確認します。残高が合わない、またはマイナスの現象が回避された場合は、これで完了です。
残高が合わない、またはマイナスの現象が回避されない場合はステップ1-2 ［期中の残高］を確認するに進みます。